句子结构是：
主句：I am sorry to hear that ——主句中的 that 是代词,指代已知的事物.
同位语从句：that you said I am sorry to hear that ——that 是引导名词性从句的连词,其中I am sorry to hear that 是嵌套宾语从句）
同位语从句是用来解释前面提到事物的具体内容,句中的 that you said I am sorry to hear that 就是对前面提到的 that 的具体解释,相当于汉语的“即”、“也就是说”.本句的具体含义是“很遗憾听到这件事,也就是说这件事是你说过我遗憾地听到这件事”.
不过原句有些毛病,后面宾语从句中的时态应该改为 I was sorry to hear that,这样才能与 you said 的时态保持一致.