解题思路：光合作用的光反应阶段有ATP的生成，场所是叶绿体的类囊体薄膜；有氧呼吸的三个阶段都有ATP的生成，场所分别是细胞质基质、线粒体基质和线粒体内膜；植物体内的葡萄糖是细胞的主要能源物质，而直接利用的能量载体是ATP；PH能通过影响酶的活性进而影响光合作用和细胞呼吸；叶片中各种色素的含量多少与植物的种类及发育阶段有关．
A、光合作用的光反应阶段有ATP的生成，场所是叶绿体的类囊体薄膜；有氧呼吸的三个阶段都有ATP的生成，场所分别是细胞质基质、线粒体基质和线粒体内膜，A错误；
B、植物体内的葡萄糖是细胞的主要能源物质，而直接利用的能量载体是ATP，B错误；
C、PH能通过影响酶的活性进而影响光合作用和细胞呼吸，C错误；
D、叶片中各种色素的含量多少与植物的种类及发育阶段有关，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 细胞呼吸的过程和意义；酶的特性；ATP在生命活动中的作用和意义；叶绿体结构及色素的分布和作用．
考点点评： 本题考查有关细胞呼吸和光合作用的知识，意在考查考生能理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系，形成知识的网络结构的能力．