解题思路：A、根据构成物质的微粒进行解答；
B、根据化学反应前后原子的种类不变进行解答；
C、根据水是由水分子构成的进行解答；
D、根据在化学变化中原子是不能再分的微粒进行解答．
A、构成物质的微粒有分子、原子和离子，所以并不是所有的物质都是由分子构成的，例如铁就是由铁原子构成的，故A错误；
B、由电解水实验可知，化学反应前后原子的种类不变，故B正确；
C、水是由水分子构成的，所以保持水的化学性质的最小微粒是水分子，故C错误；
D、在化学变化中原子是不能再分的微粒，故D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 分子、原子、离子、元素与物质之间的关系；原子的定义与构成；分子的定义与分子的特性；化学反应的实质．
考点点评： 了解分子、原子、离子、元素与物质之间的关系；分子是保持物质化学性质的微粒；原子是化学变化中最小的微粒．