解题思路：根据题意先计算1600人拥有的色盲基因的总数目，再减去已知个体拥有的色盲基因的数目，即可得男生色盲基因的数目．
已知某校共有学生人数1600人，其中女生780人，则男生1600-780=820人，因为色盲基因在X染色体上，所以1600人与色盲有关的基因一共有780×2+820=2380个．根据基因频率的概率进行计算可得到1600一共拥有的色盲基因数是2380×6.8%，约等于162个，则男生色盲人数=总色盲基因数-女生拥有的色盲基因数=162-23×2-52=64人．
故选：C．
点评：
本题考点： 伴性遗传．
考点点评： 题考查伴性遗传的相关知识，意在考查考生理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系、分析题意以及解决问题的能力．