解题思路：已知两对基因独立遗传，遵循基因的自由组合定律．根据杂交后代的性状及植株数分别为高茎圆形果120株，高茎梨形果128株，矮茎圆形果42株，矮茎梨形果38株来判断亲本的基因型．
已知番茄高茎（T）对矮茎（t）为显性，圆形果实（S）对梨形果实（s）为显性，所以高茎梨形果的植株的基因型为T-ss，根据F1与表现型为高茎梨形果的植株杂交，其杂交后代的性状及植株数分别为高茎圆形果120株，高茎梨形果128株，矮茎圆形果42株，矮茎梨形果38株=3：3：1：1，分析发现高茎：矮茎=3：1，说明亲本是Tt×Tt；同时后代中圆形果：梨形果=1：1，说明双亲是Ss×ss．所以F1的基因型是TtSs．而F1是由两个纯合亲本杂交后得到的，所以两个亲本的基因型是TTSS、ttss或TTss、ttSS．
故选：D．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因的自由组合定律的实质及应用相关知识点，意在考查学生对所学知识的理解与掌握程度，培养学生判断基因型和表现型的能力．