解题思路：阅读题干可知，该题涉及的知识点是酶的本质和组成单位，必需氨基酸和非必需氨基酸的划分依据，蛋白质多样性的原因，细胞分化的实质和细胞凋亡，明确知识点后，对相关知识进行梳理，然后分析选项进行解答．
A、酶的本质是蛋白质或RNA，因此酶是由氨基酸或核糖核苷酸组成的，A错误；
B、必需氨基酸是人体不能合成，只能从食物中获得的氨基酸，B错误；
C、蛋白质多样性与氨基酸的种类、数目、排列顺序和空间结构有关，细胞内氨基酸种类和数量相同的蛋白质不一定是同一种蛋白质，C错误；
D、细胞凋亡过程与细胞凋亡有关的基因进行表达，因此在细胞凋亡过程中，细胞会产生新的蛋白质，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 蛋白质的结构和功能的综合．
考点点评： 对于酶的本质和组成单位、必需氨基酸和非必需氨基酸的划分依据、蛋白质多样性的原因、细胞分化的实质和细胞凋亡的综合理解应用，把握知识点间的内在联系，并利用相关知识进行合理推理做出判断或得出正确结论的能力 是本题考查的重点．