解题思路：基因通过中心法则控制性状，包括两种方式：（1）通过控制酶的合成控制代谢过程，间接控制生物体的性状；（2）可通过控制蛋白质的结构直接控制生物的性状．
A、基因1与基因2分别控制着不同的性状，故二者不是一对等位基因，A错误；
B、X1，X2指的可能是用于合成氨基酸的mRNA，不同的细胞负责合成血红蛋白、黑色素，故不会出现在同一个细胞内，B正确；
C、基因通过控制酶的合成控制代谢过程，间接控制生物体的性状，如镰刀型细胞贫血症：血红蛋白基因突变→血红蛋白结构异常→红细胞呈镰刀状蔗糖多→水分保留少，X1的形成过程中发生基因突变，C错误；
D、“酪氨酸酶基因异常→缺少酪氨酸酶→制约酪氨酸转化为黑色素→白化病”的过程是基因通过控制蛋白质的结构直接控制生物的性状，但镰刀型细胞贫血症的形成则是基因通过控制酶的合成控制代谢过程，间接控制生物体的性状，D错误．
故答：B
点评：
本题考点： 基因与性状的关系；细胞的分化．
考点点评： 本题的知识点是基因对性状的控制途径，对于相关知识点的综合理解并把握知识点间的内在联系是解题的关键．