解题思路：1、线粒体是有氧呼吸的主要场所，有氧呼吸的第三阶段是在线粒体内膜上进行的；
2、物质出入细胞的方式有主动运输、被动运输、胞吞或胞吐；
3、酶与激素是生物体活细胞产生的两类重要的生物活性物质，酶是生物催化剂，对新陈代谢中的各种生化反应具有催化作用．激素是调节物质，不参加具体的代谢过程，只对特定的代谢和生理过程的速度和方向起调节作用，从而使机体的活动更适应于内外环境的变化；
4、剧烈运动时骨骼肌细胞也主要进行有氧呼吸．
解；A、有氧呼吸中，线粒体内膜可把储存在有机物中的化学能转换成储存在ATP中的化学能和热能，在光合作用的光反应中，叶绿体的类囊体膜上可把光能转变成储存在ATP中的化学能，A正确；
B、小分子物质进入细胞的方式可能是被动运输，也可能是主动运输，B错误；
C、酶在细胞代谢中只起催化作用，C错误；
D、剧烈运动时骨骼肌细胞的呼吸方式主要是有氧呼吸，有氧呼吸产生C02，D错误．
故选：A．
点评：
本题考点： 线粒体、叶绿体的结构和功能；物质跨膜运输的方式及其异同；细胞呼吸的过程和意义．
考点点评： 本题的知识点是主动运输和被动运输，叶绿体和线粒体的功能，酶在代谢中的作用，有氧呼吸和无氧呼吸的产物，主要考查学生对基础知识的理解和运用能力．