解题思路：阅读题干可知，该题的知识点是观察细胞中的线粒体和叶绿体实验，回忆该实验的原理和过程，然后分析选项进行解答．
A、健那绿是专一性染线粒体的活细胞染料，A正确；
B、可通过观察叶绿体或线粒体的运动间接观察细胞质的流动，B正确；
C、植物根尖细胞没有叶绿体，可以以植物的根尖细胞为实验材料可观察线粒体，C正确；
D、线粒体和叶绿体有两层磷脂双分子层，在光学显微镜下观察不到，D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 线粒体、叶绿体的结构和功能．
考点点评： 对于观察细胞中的线粒体和叶绿体实验的掌握是本题考查的重点．