解题思路：生态系统是由生物部分和非生物部分组成，生物部分包括生产者、消费者和分解者．生产者为自身和生态系统中的其他生物提供营养物质和能量，所以其营养方式必须是自养，包括绿色植物和进行化能合成作用的硝化细菌等．
A、生态系统中的生产者90%以上是绿色植物，A正确；
B、生产者主要是指绿色植物，它们能利用光能，通过光合作用，把无机物制造成有机物，并将光能转变为化学能储存在有机物中．这些有机物不仅为生产者自身提供了营养物质和能量，而且也为生态系统中的其它生物提供了食物来源．B正确；
C、食物链的起点时生产者，属于第一营养级，C正确；
D、生产者都是自养生物，的错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 生态系统的结构．
考点点评： 考查生产者的概念，明确生产者在生态系统中的作用是解题的关键．