同学,从你问问题的情况我猜想你可能有些基本问题很含糊.
我试着分析一下.
1.首先PCR是体外大量扩增目的DNA的技术.
你问模板DNA是什么,这是不需要问的,你想扩增的目的基因是什么什么就是模板.你用cDNA来做PCR模板当然是cDNA双链了.（一定是双链）
cDNA做模板,引物当然不是cDNA了,而是可以与cDNA单链互补配对的一段寡核苷酸.（引物是设计的）
总结一下
mRNA是已经去除了内含子的→反转录出cDNA单链→合成双链cDNA→pcr,得到的大量cDNA产物,相当于对真核生物DNA的有用信息（我们想研究的信息---外显子）做了扩增.
2 mRNA反转录不会丢失片段.真核DNA转录初级产物是带内含子的,切除内含子后连接外显子就得到了mRNA.
3 直接提取的真核DNA做PCR,得到的是完整的DNA产物.至于你问怎么得到目的基因,我不太能理解.首先你要知道你的目的基因是什么,你的目的基因是真核生物的完整DNA,就用DNA做PCR；目的基因是cDNA就用cDNA做PCR.
弄清PCR过程,原理,和一些名词,再看你的问题,你会发现根本不是问题.
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