（1）顺式作用元件：能影响基因表达,但不编码RNA和蛋白质的DNA序列；
其中包括：
启动子：RNA聚合酶特异性识别结合和启动转录的DNA序列.有方向性,位于转录起始位点上游.
上游启动子元件：TATA盒上游的一些特定DNA序列,反式作用因子可与这些元件结合,调控基因的转录效率.
反应元件：与被激活的信息分子受体结合,并能调控基因表达的特异DNA序列.
增强子：与反式作用因子结合,增强转录活性,在基因任意位置都有效,无方向性.
沉默子：基因表达负调控元件,与反式作用因子结合,抑制转录活性.
Poly(A)加尾信号：结构基因末端保守的AATAAA顺序及下游GT或T富含区,被多聚腺苷酸化特异因子识别,在mRNA 3′端加约200个A.
（2）反式作用因子：能识别和结合特定的顺式作用元件,并影响基因转录的一类蛋白质或RNA.