解题思路：植物在光照条件下进行光合作用，光合作用分为光反应阶段和暗反应阶段，光反应阶段在叶绿体的类囊体薄膜上进行水的光解，产生ATP和[H]，同时释放氧气，ATP和[H]用于暗反应阶段三碳化合物的还原，细胞的呼吸作用不受光照的限制，有光无光都可以进行，为细胞的各项生命活动提供能量．据此分析解答．
A、X物质是C3化合物，Y物质是丙酮酸，A正确；
B、①过程是1分子葡糖糖分解为两分子的丙酮酸和[H]，释放少量能量，④过程是丙酮酸和水生成二氧化碳和[H]，释放少量能量，②过程是C3的还原，需要消耗能量，B正确；
C、①②③④四个过程中呼吸作用和光合作用速率相等，既没有消耗氧气，也没有产生氧气，C正确；
D、①过程是1分子葡糖糖分解为两分子的丙酮酸和[H]，释放少量能量，反应的部位是细胞质基质，②过程是C3的还原，发生反应的部位是叶绿体基质，D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 光反应、暗反应过程的能量变化和物质变化；细胞呼吸的过程和意义．
考点点评： 本题考查光合作用和呼吸作用的相关知识，意在考查考生能理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系，形成知识的网络结构的能力．