解题思路：1、假说-演绎法：在观察和分析基础上提出问题以后，通过推理和想像提出解释问题的假说，根据假说进行演绎推理，再通过实验检验演绎推理的结论．如果实验结果与预期结论相符，就证明假说是正确的，反之，则说明假说是错误的．例如孟德尔的豌豆杂交实验、摩尔根研究的伴性遗传等．
2、类比推理法：类比推理指是根据两个或两类对象在某些属性上相同，推断出它们在另外的属性上（这一属性已为类比的一个对象所具有，另一个类比的对象那里尚未发现）也相同的一种推理．萨顿的假说“基因在染色体上”运用了类比推理法．
3、模型构建法：模型是人们为了某种特定的目的而对认识对象所做的一种简化的概括性的描述，这种描述可以是定性的，也可以是定量的；有的借助具体的实物或其它形象化的手段，有的则抽象的形式来表达．模型的形式很多，包括物理模型、概念模型、数学模型等．以实物或图画形式直观的表达认识对象的特征，这种模型就是物理模型．沃森和克里克制作的著名的DNA双螺旋结构模型，就是物理模型．
A、摩尔根通过实验验证孟德尔的遗传理论和萨顿假说的过程体现了“假说一演绎”思想，A正确；
B、孟德尔对分离现象的原因提出的假说的核心内容是：“性状是由成对的遗传因子决定的”，孟德尔时代还没有基因、染色体概念，B错误；
C、沃森和克里克运用模型建构法发现了DNA双螺旋结构，C正确；
D、孟德尔所设计的测交实验的目的是验证演绎推理的正确性，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 孟德尔遗传实验；DNA分子结构的主要特点．
考点点评： 本题考查遗传学中的科学研究方法的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．