解题思路：已知1个DNA分子区段具有100个碱基对，即200个碱基，其中含有40个胸腺嘧啶（T），根据碱基互补配对原则，A=T=40个，则C=G=100-40=60个．
由以上分析可知，该DNA分子区段含有60个胞嘧啶脱氧核苷酸．根据DNA半保留复制的特点，如果该DNA连续复制两次，需游离的胞嘧啶脱氧核苷酸数目=（22-1）×60=180个．
故选：D．
点评：
本题考点： DNA分子结构的主要特点；DNA分子的复制．
考点点评： 本题考查DNA分子结构的主要特点、DNA分子的复制，首先要求考生识记DNA分子结构的主要特点，能运用碱基互补配对原则计算出该DNA区段中胞嘧啶脱氧核苷酸数目；其次根据DNA半保留复制的特点，计算出相应的数据．