首先,微生物并不是一个分类学单位,而是一个泛称,指一切微小的、肉眼看不见的生物.这里面就包括了细菌（真细菌）、古细菌、霉菌、酵母菌、放线菌、衣原体、支原体、立克次氏体、病毒,还有一些单细胞的原生生物、藻类等.
除病毒外,它们都有细胞结构,都是以DNA为遗传物质,原核细胞就是裸露的环状DNA,真核细胞就是与组蛋白结合的线装DNA（染色体）.它们确实都含有RNA,但不是作为遗传物质,而是信使RNA、转运RNA、核糖体RNA,参与遗传信息的转录和翻译.
病毒又分为真病毒、类病毒、拟病毒、朊病毒.对于真病毒、类病毒和拟病毒,有的种是以DNA为遗传物质,有的则是RNA.朊病毒比较特殊,它是一种有侵染能力的蛋白质,不含DNA或RNA,它在寄主体内诱导具有相同序列的蛋白质发生构象改变,而产生跟它一样的致病性蛋白质.由朊病毒引起的疾病有,疯牛病、羊搔痒症、人类克雅氏病,等.