解题思路：1、XYY综合征个体的形成是减数第二次分裂两条姐妹染色单体未分离造成的．
2、线粒体DNA突不涉及减数分裂同源染色体联会行为．
3、三倍体西瓜植株的高度不育的原因是：三倍体减数分裂时联会紊乱，不能将遗传物质均等的分配到两个子细胞．
4、卵裂是受精卵早期进行的有丝分裂．
A、XYY综合征个体的形成是减数第二次分裂两条姐妹染色单体未分离造成的，与减数分裂同源染色体联会行为无关，A错误；
B、线粒体DNA突变会导致在培养大菌落酵母菌时出现少数小菌落，与减数分裂同源染色体联会行为无关，B错误；
C、三倍体西瓜植株的高度不育的原因是：三倍体减数分裂时联会紊乱，不能将遗传物质均等的分配到两个子细胞，与减数分裂同源染色体联会行为有关，C正确；
D、卵裂是受精卵早期进行的有丝分裂，与与减数分裂同源染色体联会行为无关，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 染色体数目的变异．
考点点评： 本题考查了染色体数目变异的时间，有丝分裂，减数分裂都有可能导致染色体数目变异，但是质基因变异不会，因为细胞质中没有染色体．