解题思路：本题主要考查了现代生物进化理论的内容．
种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质是种群基因频率的改变．突变和基因重组，自然选择及隔离是物种形成过程的三个基本环节，通过它们的综合作用，种群产生分化，最终导致新物种形成．在生物进化过程中，突变和基因重组产生生物进化的原材料，自然选择使种群的基因频率定向改变并决定生物进化的方向，隔离是新物种形成的必要条件．
A、基因库是由种群中所有个体的全部基因组成的，A错误；
B、生物进化的实质是种群基因频率的改变，B正确；
C、具有生殖隔离的两个种群未必存在地理隔离；具有地理隔离的两个种群未必存在生殖隔离，C正确；
D、共同进化导致生物多样性的形成，D正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 生物进化与生物多样性的形成．
考点点评： 本题主要考查了学生对基础知识的记忆和理解能力．在解题时要掌握知识的关键所在．