A、化石是由古代生物的遗体、遗物或生活痕迹等，由于某种原因被埋藏在地层中，经过漫长的年代和复杂的变化而形成的．在研究生物进化的过程中，化石是最直接的、比较全面的证据．不符合题意．
B、在研究生物进化中，达尔文提出了进化的观点，地球上丰富多彩的生物是由最初的原始生命逐渐进化来的，不符合题意．
C、生物进化的内在因素生物产生了可遗传的变异，正是产生了可遗传的变异类型，其中更适应变化的、复杂的环境，被选择保留下来．不符合题意．
D、脊椎动物的进化历程是：鱼类→两栖类→爬行类→鸟类和哺乳类．符合题意．
故选：D