解题思路：图为高等植物叶肉细胞结构模式图，图中1是线粒体，2是叶绿体，3是细胞核，4是液泡，5是细胞质基质．有氧呼吸过程和光合作用过程均能产生ATP．生物膜的基本骨架是磷脂双分子层．
A、该细胞能产生ATP的结构有细胞质基质、线粒体和叶绿体，故A正确；
B、由于线粒体和叶绿体均为双层膜结构，因此1中产生的一分子C02扩散出来进入2中被利用，要穿过4层膜，即4层磷脂双分子层，故B正确；
C、叶绿素和类胡萝卜素是叶绿体中含有的色素，液泡中含有花青素，故C错误；
D、3是细胞核，细胞核是遗传物质储存和复制的主要场所，是细胞遗传特性和细胞代谢活动的控制中心，故D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同；线粒体、叶绿体的结构和功能；细胞器中其他器官的主要功能；细胞核的结构和功能．
考点点评： 本题难度不大，但是考生易错的题型，本题通过植物细胞结构图综合考查了多项知识：细胞核的功能、ATP的产生场所、色素的种类、生物膜的结构等方面的内容．细胞质基质也能产生ATP往往是考生已忽略的知识点，并且4层生物膜即为4层磷脂双分子层．