区别并不是那么严格.
(pay) on installment 强调的是付款的情况、条件等
(pay) in installment 强调的是付款方式.
on installment 分期付款（符合条件）
例如：
If you can't pay for the house in cash,you can buy it on installment.
如果你不能用现金购房,也可以分期付款.
in installment 分期付款 （选择这种付款方式）
例如：
Can I pay in installment?
我可以分期付款吗?.