解题思路：本题主要考查呼吸作用和光合作用的过程．
1、呼吸作用是指生物体内的有机物在细胞内经过一系列的氧化分解，最终生成二氧化碳或其他产物，并且释放出能量的总过程．有氧呼吸的第一、二、三阶段的场所依次是细胞质基质、线粒体基质和线粒体内膜．有氧呼吸第一阶段是葡萄糖分解成丙酮酸和[H]，合成少量ATP；第二阶段是丙酮酸和水反应生成二氧化碳和[H]，合成少量ATP；第三阶段是氧气和[H]反应生成水，合成大量ATP．
2、光合作用是指绿色植物通过叶绿体，利用光能把二氧化碳和水转变成储存着能量的有机物，并释放出氧气的过程．光合作用的光反应阶段（场所是叶绿体的类囊体膜上）：水的光解产生[H]与氧气，以及ATP的形成．光合作用的暗反应阶段（场所是叶绿体的基质中）：CO2被C5固定形成C3，C3在光反应提供的ATP和[H]的作用下还原生成淀粉等有机物．
（1）黑藻在光照条件下，既进行光合作用又进行呼吸作用，光合作用的暗反应阶段和有氧呼吸的第三阶段消耗[H]，因此消耗[H]的场所叶绿体基质和线粒体内膜．光合作用的光反应阶段产生O2，因此释放O2的场所类囊体薄膜．
（2）据图1可知，两曲线的交点代表黑藻的净光合速率大于衣藻的净光合速率衣藻，衣藻和黑藻生长的最适温度分别为30℃、不低于35℃（或不确定）．
（3）①据图2可知，衣藻在光照强度为63μmol•m-2•s-1时达到光饱和点，衣藻生长的最适温度为30℃，因此限制衣藻净光合速率上升的环境因素主要是二氧化碳浓度．
②在35℃时两种藻类净光合速率与光照强度的关系，绘制成相关曲线．（具体见答案）
故答案为：
（1）叶绿体基质和线粒体内膜 类囊体薄膜
（2）大于 30℃不低于35℃（或不确定）
（3）①二氧化碳浓度
②
点评：
本题考点： 光反应、暗反应过程的能量变化和物质变化；有氧呼吸的过程和意义．
考点点评： 本题以图形为载体，考查学生对光合作用过程和呼吸作用过程的联系．光合作用和呼吸作用过程是考查的重点和难点，可以通过流程图分析，表格比较，典型练习分析强化学生的理解．光合作用合成有机物，而呼吸作用分解有机物．光合作用为呼吸作用提供有机物和氧气，呼吸作用为光合作用提供二氧化碳和水．