解题思路：根据题意酵母菌属于真核生物、乳酸菌属于原核生物、硝化细菌属于原核生物、蓝藻属于原核生物、烟草花叶病毒属于病毒、噬菌体属于病毒．
A、从组成成分上看，除烟草花叶病毒外，所有生物都含有蛋白质和DNA，A错误；
B、从结构上看，①为真核生物，②③④为原核生物，⑤⑥为病毒，B错误；
C、从同化作用类型上看，①②为异养型，而③④能进行化能合成作用和光合作用，所以为自养型，C正确；
D、从生态系统的成分上看，①②是分解者，③④是生产者，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同．
考点点评： 本题考查微生物的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题和解决问题的能力．