黄河上游突出的生态环境问题是荒漠化严重,上游的水文特征冬季有结冰现象,春季有凌汛现象.
治理措施：退耕还林还草,减少放牧,禁止乱砍滥伐,增加植被覆盖量；春季的凌汛,可以使用炸冰船,防止水患.
中游突出的生态环境问题是水土流失,致使黄河中游河段含沙量大增.
治理的措施是植树造林,退耕还林还草,将生态措施和工程措施相结合,将环境效益和经济效益相结合；
下游突出的生态环境问题是土地盐碱化问题,断流现象.下游的水文特征除了有结冰期、含沙量等问题外,还有地上河的水患,凌汛现象.
土地盐碱化的治理措施是改良灌溉方式；平整土地、改良耕作、施肥、播种、轮作、间种套种等种植技术,种植耐盐植物和牧草、绿肥、植树造林等；施用改良物质,如石膏、磷石膏、亚硫酸钙等；下游的地上河的治理措施是加固两岸大堤,用水电站调沙,调水,减少下游泥沙沉积,避免断流现象发生.
全流域都存在污染现象,可以加大监管力度,使沿岸企业污水达标排放.