解题思路：现代生物进化理论的基本观点：种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质在于种群基因频率的改变；突变和基因重组产生生物进化的原材料；自然选择决定生物进化的方向；隔离是新物种形成的必要条件．共同进化是指不同物种之间，生物与无机环境之间在相互影响中不断进化和发展．共同进化是生物多样性形成的原因．
A、进化过程中出现的新物种，有些是靠开辟环境中新的生存位置来生存和繁衍的，不一定就比原来的物种适应能力更强，A错误；
B、共同进化是生物多样性形成的原因，B正确；
C、只有可遗传的变异才能为进化提供原材料，C错误；
D、种群基因频率的改变意味着生物进化，但不意味着新物种的形成，D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 基因频率的变化；现代生物进化理论的主要内容；生物的多样性．
考点点评： 本题考查现代生物进行理论的主要内容、生物多样性，要求考生识记现代生物进化理论的主要内容，识记生物多样性的概念及形成的原因，能运用所学的知识准确判断各选项，属于考纲识记和理解层次的考查．