(1)平行于圆锥某一母线的截面是等腰三角形,不正确;
(2)平行于圆台某一母线的截面是等腰三角形,可能是四边形,不正确;
(3)过圆锥顶点的截面是等腰三角形;正确;
(4)过圆台上底面中心的截面是等腰三角形,是等腰梯形.不正确.
故选D.