革兰阳性菌细胞壁特殊组分
细胞壁较厚,约20 nm～80 nm.肽聚糖含量丰富,有15层～50层,每层厚度1 nm,约占细胞壁干重的50%～80%.此外,尚有大量特殊组分磷壁酸（图2-5）.磷壁酸是由核糖醇或甘油残基经由磷酸二酯键互相连接而成的多聚物.磷壁酸分壁磷壁酸和膜磷壁酸2种,前者一端同细胞壁中肽聚糖的N-乙酰胞壁酸连接,膜磷壁酸又称脂磷壁酸(LTA),一端与细胞膜连接,它们的另一端均游离于细胞壁外.磷壁酸抗原性很强,是革兰阳性菌的重要表面抗原；在调节离子通过粘肽层中起作用；也可能与某些酶的活性有关；某些细菌的磷壁酸,能粘附在人类细胞表面,其作用类似菌毛,可能与致病性有关.此外,某些革兰阳性菌细胞壁表面还有一些特殊的表面蛋白,如A群链球菌的M蛋白等,与致病有关.
革兰阴性菌细胞壁特殊组分
细胞壁较薄（10 nm～15 nm）,但结构比较复杂.除含有1层～2层肽聚糖（约占细胞壁干重的5%～20%）外,尚有特殊组分外膜（约占细胞壁干重的80%）.外膜位于肽聚糖层的外侧,由脂蛋白、脂质双层、脂多糖三部分组成.
脂蛋白 一端以蛋白质部分共价键连接于肽聚糖的四肽侧链上,另一端以脂质部分经共价键连接于外膜的磷酸上.其功能是稳定外膜并将之固定于肽聚糖层.
脂质双层 是革兰阴性菌细胞壁的主要结构,除了转运营养物质外,还有屏障作用,能阻止多种物质透过,抵抗许多化学药物的作用,所以革兰阴性菌对溶菌酶、青霉素等较革兰阳性菌具有较大的抵抗力.一些化学物质如乙二胺四乙酸（EDTA）、2%十二烷基硫酸钠（SDS）或45%酚水溶液可以将外膜除去,而留下坚韧的肽聚糖层.此外,外膜蛋白质还可作为某些噬菌体和性菌毛的受体.
脂多糖（LPS） 由脂质双层向细胞外伸出而成,包括脂质A、核心多糖、特异性多糖三个组成部分,习惯上将脂多糖称为细菌内毒素.①脂质A 为一种糖磷脂,由β-1′,6糖苷键联结的D-氨基葡萄糖双糖组成的基本骨架,其上的游离羟基和氨基可结合多种长链脂肪酸和磷酸基团.它是脂多糖的毒性部分和生物学活性的主要组分.为革兰阴性菌的致病物质.无种属特异性,各种革兰阴性菌内毒素引起的毒性作用大致相同.②核心多糖 位于脂质A的外层,由已糖、庚糖、2-酮基-3-脱氧辛酸（KDO）、磷酸乙醇胺等组成.经KDO与脂质A共价联结.核心多糖具有属特异性,同一属细菌的核心多糖相同.③特异性多糖 在脂多糖的最外层,是由数个至数十个低聚糖（3～5单糖）重复单位所构成的多糖链.革兰阴性菌的菌体抗原（O抗原）即为特异性多糖.各种不同的革兰阴性菌的特异性多糖种类及排列顺序各不相同,从而决定了细菌种的特异性.