解题思路：据图分析①线粒体、②中心体、③核糖体、④高尔基体、⑤细胞质基质、⑥细胞核，由此确定该细胞属于真核细胞，由于细胞中含有中心体，可能属于动物细胞或者是低等的植物细胞．
A、图示为细胞的亚显微结构，因此只能在电子显微镜下观察到，A错误；
B、结构1为线粒体，线粒体在有氧呼吸的第三阶段能够产生水，结构3为核糖体，核糖体在合成蛋白质过程中要脱水缩合，也能产生水，B正确；
C、ATP是生命活动的直接能源物质，细胞核在转录过程中需要消耗能量，因此需要细胞呼吸提供，C错误；
D、图中有两个中心粒，即一个中心体，D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同．
考点点评： 本题设计巧妙，以视野的一部分考查了细胞的相关知识，提升了考生提取信息、分析问题的能力，涉及的知识点有：中心体的分布、细胞器的功能、RNA的分布等，要求考生具有扎实的知识储备．