1生物催化作用：生命的基本特征是物质代谢,而物质代谢全部反应几乎都需要酶作为催化剂,而多数酶的化学本质是蛋白质
2代谢调节作用：生物体存在精细有效的调节系统以维持正常的生命活动.参与代谢调节的许多激素是蛋白质或多肽,如胰岛素等
3免疫保护作用：机体的免疫功能与抗体有关,而抗体是一类特异的球蛋白
4转运和储存的作用：体内许多小分子物质的转运和储存可由一些特殊的蛋白质来完成.如血红蛋白运输氧和二氧化碳,肌红蛋白储存氧等
5运动与支持作用：负责运动的肌肉系统主要是蛋白质聚集体
如肌动蛋白,肌球蛋白,原肌球蛋白和肌原蛋白等
6控制生长和分化：如真核生物的大多数反式作用因子等
7接受和传递信息的作用：完成这种功能的蛋白质为受体蛋白,其中一类为跨膜蛋白,另一类为胞内蛋白
8营养作用：这一类蛋白质本身没有生物功能,只是在机体需要的时候水解成氨基酸,为其他蛋白质的合成提供原料.这一类蛋白质常见于卵或蛋内,如卵清蛋白等