解题思路：1、对照性的探究实验应注意变量的惟一性．
2、种子萌发的条件：①自身条件：胚完整而且活着，并有足够的水分、无机盐、淀粉、蛋白质和脂肪等．②外界条件：适量的水分、适宜的温度和充足的空气．
（1）本实验探究水对种子萌发的影响，所以应设计有唯一变量--水分，其它空气、温度等必须相同．
（2）题目设计了两组同学的实验，我们却发现两组实验都有不足之处：A组不科学在于对照组与实验组中种子的数量不相等．B组不科学在于没有设置对照组．B组的设计可以改为与B组只有一个不同的是缺水，其余都相同的装置．
都没有遵循对照性的探究实验应注意变量的惟一性．
（3）种子萌发的外部条件可能因素有很多．如温度对种子的萌发有影响吗？或土壤对种子的萌发有影响吗？或空气对种子的萌发有影响吗？或阳光对种子的萌发有影响吗？等等．
故答案为：（1）水分
（2）A组不科学，理由是对照组与实验组中种子的数量不相等；B组也不科学，理由是没有设对照组．与B组只有一个不同的是缺水，其余都相同的装置
（3）还有温度、土壤、空气等．温度对种子的萌发有影响吗？或土壤对种子的萌发有影响吗？或空气对种子的萌发有影响吗？或阳光对种子的萌发有影响吗？等等
点评：
本题考点： 探究种子萌发的条件．
考点点评： 对照性的探究实验应注意变量的惟一性．除变量以外的条件必须都相同．