一般一个密码子的第三个碱基没有特异性,密码的简并对于有害突变的可能性降低有重大大意义,也就是说即使密码子改变了,也有可能合成原来的氨基酸.
密码子简并性具有重要的生物学意义,它可以减少有害突变.若每种氨基酸只有一个密码子,61个密码子中只有20个是有意义的,各对应于一种氨基酸.剩下41个密码子都无氨基酸所对应,将导致肽链合成终止.由基因突变而引起肽链合成终止的概率也会大大增加.简并性使得那些即使密码子中碱基被改变,仍然能编码原来氨基酸的可能性大为提高.密码的简并也使DNA分子上碱基组成有较大余地的变动,例如细菌DNA中G+C含量变动很大,但不同G+C含量的细菌却可以编码出相同的多肽链.所以遗传密码的简并性在物种的稳定上起着重要的作用.