∵E是BB 1的中点且AA 1=2,AB=BC=1,
∴∠AEA 1=90°,
又在长方体ABCD-A 1B 1C 1D 1中,AD⊥平面ABB 1A 1,
∴A 1D 1⊥AE,
∴AE⊥平面A 1ED 1,
故选B