设CD=xcm,
∵四边形ABCD是矩形,
∴AB=CD,AD=BC,∠A=∠D=90°,
∵EF⊥EC,
∴∠FEC=90°,
∴∠AFE+∠AEF=90°,∠AEF+∠DEC=90°,
∴∠AFE=∠DEC,
在△AFE和△DCE中,
∠AFE=∠DEC
∠A=∠D
EF=EC ,
∴△AFE≌△DCE(AAS),
∴AE=DC=xcm,
∵DE=2cm,
∴AD=BC=(x+2)cm,
∵矩形ABCD的周长为24cm,
∴2(x+x+2)=24,
x=5,
即AE=5cm,
故答案为:5.