古文中的"耳"没有"原因"的意思.用在句末有两种用法：
1.语气词.表示限止语气,与“而已”、“罢了”同义.
《论语·阳货》：“子曰：‘二三子!偃 之言是也,前言戏之耳.’”
唐 柳宗元 《三戒·黔之驴》：“虎因喜,计之曰：‘技止此耳!’” 宋 沈括 《梦溪笔谈·象数一》：“月本无光,犹银丸,日耀之乃光耳.”
2.语气词.表示肯定语气或语句的停顿与结束.
《荀子·天论》：“君子小人之所以相县者在此耳!”
《史记·淮阴侯列传》：“诸将,易得耳；至如 信 者,国士无双.”
南朝 宋 刘义庆 《世说新语·识鉴》：“ 戴安道 年十余岁,在 瓦官寺 画,王长史 见之,曰：‘此童非徒能画,亦终当致名,恨吾老不见其盛时耳.’”
就此句中而言,应为第二种用法,表示肯定语气.“本所以疑,正为此耳.”应译为：“当初之所以迟疑,就是因为怕遇上这事啊!”