A、一条染色体上只有一个DNA分子，一个DNA分子有很多个基因组成．故该选项不符合题意；
B、生物的性状是由成对的基因决定的，同一种生物，同一种性状的不同表现形式，称为相对性状．显性基因控制显性性状，隐性基因控制隐性性状，当控制某个性状的基因一个是显性，一个是隐性时，只表现出显性基因控制的性状．因此，一对相对性状分别由一对基因控制．故该选项符合题意；
C、染色体有DNA和蛋白质组成，一条染色体上只有一个DNA分子．故该选项不符合题意；
D、生物的性状是由基因决定的，不同生物的性状不同．表明不同种生物细胞含有染色体不同数目相同．故该选项不符合题意．
故选：B．