气候、水文、地形地貌、地质等自然地理条件通过影响人口分布影响城市的分布与发展.
（1）气候因素
气温和降水适中的地区人口稠密,有利于城市的形成与发展.中纬度沿海地区气候温暖湿润城市较多,例如世界上三大城市群的分布；
（2）地形、地貌因素
平原区有利于农业发展、人们生活,平原区有利于城市基础设施建设,因此中纬度平原地区人口和城市密集.但热带地区平原区气候过于湿润,不利于人们生活,人口稀少城市较少,例如亚马孙平原区；
（3）河流因素
河流的供水功能和运输功能对城市经济发展和人们生活有利,所以在河口、河流干支流交汇处、航道的起止点容易出现城市,世界上许多大河的中下游地区,河流入海口城市密集；
（4）地质因素
城市有许多高层建筑物,这些建筑物重量很大,城市用水经常大量开采地下水,因此城市要有比较稳固的地质基础,避免发生地质灾害.城市建设尽可能避开断裂带及地壳活跃地带.
（5）其他自然因素
城市的水域、绿地也影响城市的发展,较大城市占地面积很大,要有足够大面积的土地,以利于城市中各功能区的合理布局.