解题思路：本题是对酶的概念和本质、组成蛋白质的氨基酸的种类、DNA与RNA的区别的综合性考查，梳理酶的概念和本质、组成蛋白质的氨基酸的种类、DNA与RNA的区别的相关知识，然后分析选项进行解答．
A、其催化作用的物质可能是蛋白质，也可能是RNA，A错误；
B、构成蛋白质的 氨基酸有20种，B错误；
C、基因的本质是DNA，所含的碱基是C、G、A、T4种，没有碱基U，C错误；
D、蛋白酶和肽酶的本质是蛋白质，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 酶的概念；氨基酸的种类；核酸的种类及主要存在的部位．
考点点评： 本题的知识点是酶的本质和作用，基因的本质，DNA与RNA的区别，组成蛋白质的氨基酸的种类，对于相关知识点的理解和应用是解题的关键．