解题思路：根据题意可知，红眼长翅的雌果蝇（B_XAX-）与红眼长翅的雄果蝇（B_XAY）交配，后代雄果蝇中长翅：残翅=3：1，因此确定亲本均为杂合子（Bb×Bb）；又因为雄果蝇中红眼：白眼=1：1，由此确定母本基因型，再利用基因的自由组合定律进行相关计算．
（1）①根据后代雄果蝇汇总红眼：白眼=1：1，所以亲本相关基因型是XAXa×XAY；又因为长翅：残翅=3：1，且没有性别的差异，说明是常染色体遗传，且亲本的相关基因型为Bb×Bb．由以上分析可知亲本的基因型为BbXAXa×BbXAY．
已知亲本的基因型为BbXAXa×BbXAY，后代与亲本表现型相同的个体=[3/4×
1
2+
3
4×
1
4＝
9
16]，则后代中与亲本表现型不同的个体占=1−
9
16＝
7
16．与亲本基因相同的个体占=与母本相同+与父本相同=[1/2×
1
4+
1
2×
1
4＝
1
4]．
②若要使子代果蝇雌雄各一种眼色，则父本应该是显性性状，母本应该是隐性性状，及选作亲本的眼色基因型为XaXa×XAY．
（2）一个基因型为BbXaY的精原细胞，减数分裂时产生了一个BbbXa的精子，由于B和b属于等位基因，位于同源染色体，因此说明常染色体的同源染色体在减一时未分离，则产生的两个次级精母细胞分别为BBbbXabXa和YY，因此减数分裂产生的另外三个精子的基因型为BXa、Y、Y，该变异属于染色体数目的变异．
故答案为：
（1）①BbXAXa、BbXAY[7/16][1/4]②XaXa、XAY
（2）BXa、Y、Y染色体变异
点评：
本题考点： 伴性遗传；染色体结构变异和数目变异．
考点点评： 本题以生物的遗传和变异为核心命题点，考查伴性遗传、基因自由组合定律、减数分裂、染色体变异等知识，综合考查考生的理解、推理能力，具有一定的难度．考生要能够根据表格中的比例对基因逐对分析；确定亲本基因型后进行相关计算，计算过程中掌握计算方法，要求算“与亲本表现型不同”，先计算相同的；能够熟练掌握减数分裂过程中等位基因和非等位基因的行为．