解题思路：（1）结合图形，令三棱锥A-BCD中AB⊥平面BCD，CD⊥平面ABC，可得（1）是正确的；（2）根据若四棱柱的两个平行侧面都垂直于底面，其侧棱不一定与底面垂直，可得（2）是错误的；（3）利用三垂线逆定理，可得S在底面的射影为底面三角形的垂心，再根据三垂线定理可得第三组对棱垂直．
对（1）如图：
三棱锥A-BCD，其中AB⊥平面BCD，CD⊥平面ABC，则三棱锥的四个面都是直角三角形，故（1）正确；
对（2），若四棱柱的两个平行侧面都垂直于底面，其侧棱不一定与底面垂直，故（2）错误；
对（3），如图：
三棱锥，SO⊥平面ABC，∵SC⊥AB，SB⊥AC，∴O为△ABC的垂心，∴AO⊥BC，由三垂线定理得：SA⊥BC，故（3）正确．
故答案为：（1），（3）．
点评：
本题考点： 棱锥的结构特征．
考点点评： 本题考查了棱锥与棱柱的结构性质，熟练掌握棱锥的结构特征是解题的关键．