两个都对.都是宾语从句.I don't know what you want.意思是 我不知道你想要什么.
I don't know which you want 意思是 我不知道你想要哪个.
两个句子的意思大体相同,细节区别在于意思的不同,因为引导词不同嘛,一个是what引导的宾语从句,一个是which引导的 所以造成这两句话意思上的细微差别.
宾语从句和定语从句的本质区别在于：从句在整个大句子中所做的成分.如果从句在大句子中做宾语的话,那这个从句就是宾语从句.如果从句在大句子中做定语的话,那这个句子就是定语从句.而不是看引导从句的是：what 还是which.虽然what不能引导定语从句,但which 既可以引导宾语从句也可以引导定语从句.所以区分从句的关键是要看从句在整个大句子里做的成分.同理,如果从句在大句子中做主语,那就是主语从句；从句做宾语了,就是宾语从句.这一点你首先要确定和清楚,之后再学具体的引导词,引导词是其次方面.