解题思路：蘑菇和蚯蚓是分解者，它们都可以促进物质循环；能量流动是逐级递减；有的病毒是有害的，有的病毒是有益的；氮、磷、硫也和碳一样，在生态系统中反复循环，据此解答．
A、森林里，朽木上的蘑菇是分解者，土壤中的蚯蚓是分解者，它们都可以促进物质循环，A错误；
B、能量流动是逐级递减，B错误；
C、病毒没有细胞结构，主要由内部的核酸和外部的蛋白质外壳组成，不能独立生存，只有寄生在活细胞里才能进行生命活动．根据病毒寄生的生物体的不同，我们把病毒分为植物病毒、动物病毒和细菌病毒，细菌病毒又叫噬菌体．有的病毒对人有害如艾滋病毒，有的可以治疗疾病对人有益，如绿脓杆菌噬菌体（细菌病毒），可以治疗绿脓杆菌感染；利用动物病毒可以防治农业害虫，利用减毒或灭毒的病毒研制疫苗来防病．因此有的病毒是有害的，有的病毒是有益的，C错误；
D、生态系统的物质循环是指组成生物体的物质在生物与无机环境之间的往返循环．在生态系统中，组成生物体的化学元素，从无机环境开始，经生产者，消费者和分解者又回到无机环境中，完成一个循环过程．如：二氧化碳和水的循环等． 所以其它物质如氮、磷、硫也和碳一样，在生态系统中反复循环，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 生态系统的组成及各部分的作用．
考点点评： 解此题的关键是理解掌握掌握生物在促进生态系统物质循环中的作用．