解题思路：阅读题干可知，该题涉及的知识点是基因突变的特点，变异的类型和在生物进化中的作用，影响基因频率变化的因素，生物进化的实质，明确知识点后，对相关知识进行梳理，然后分析选项进行解答．
A、基因突变是由遗传物质改变引起的变异，属于可遗传变异，A错误；
B、生物的变异为生物的进化提供原材料，B正确；
C、种群基因频率的变化因素包括突变和基因重组、遗传漂变、自然选择、交配方式等，环境条件适宜时，没有自然选择的影响，但可以有影响基因频率变化的其他因素，因此生物种群的基因频率可能发生变化，C正确；
D、生物进化的实质是种群基因频率的改变，不是基因型频率改变，因此种群基因型频率发生了改变，则生物不一定发生了进化，D正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 基因突变的特征．
考点点评： 本题旨在考查学生理解所学知识的要点，把握知识的内在联系，并应用相关知识对某些生物学问题进行解释、推理、判断、获取结论的能力．