(1)总体是5万名考生的成绩;故本选项错误;
(2)这种调查方式是抽样调查;故本选项正确;
(3)样本是所抽取的1000名学生的英语成绩,故本选项错误;
(4)个体是每名学生的英语成绩;故本选项正确;
故(1)(4)正确,共2个.
故选C.