解题思路：抗锈病和不抗锈病纯种小麦杂交得到F1，基因型为Aa，自交得到的F2的基因型为1/4AA，1/2Aa，1/4aa，F2中抗病品系中，AA占1/3，Aa占2/3，F2中抗病品系自交得到的F3代中AA=1/3+2/3×1/4=3/6，Aa=2/3×1/2=2/6，aa=2/3×1/4=1/6．纯种高产小麦的基因型为B1B1B2B2B3B3，纯种低产小麦的基因型为a1a1a2a2a3a3，F1的基因型为B1b1B2b2B3b3，F1自交得到的F2中，一对一对的考虑，每对基因自交后代有3种基因型，F2中小麦产量的基因型有3×3×3=27种．
A、F2中小麦产量次高是含有5个显性基因的，纯种高产小麦的基因型为B1B1B2B2B3B3，纯种低产小麦的基因型为a1a1a2a2a3a3，F1的基因型为B1b1B2b2B3b3，F1自交得到的F2中，假设第一对基因杂合，为B1b1，第二和第三对基因为显性纯合子，概率为1/2×1/4×1/4=1/32，也可能第二对杂合，第一、三对基因显性纯合，或第三对杂合，第一、二对基因显性纯合，所以F2含5个显性基因的概率为1/32×3=3/32，故A正确；
B、纯种高产小麦的基因型为B1B1B2B2B3B3，纯种低产小麦的基因型为a1a1a2a2a3a3，F1的基因型为B1b1B2b2B3b3，F1有三对等位基因，一对一对的考虑，每对基因自交后代有3种基因型，F2中小麦产量的基因型有3×3×3=27种，故B正确；
C、F2小麦中表现型为中产的小麦应有3个显性基因，即从两个亲本共6个显性基因中取出3个，可以从第一对中取出2个，第二对1个，第三对0个；或第一对2个，第二对0个，第三对1个；或第一对1个，第二对1个，第三对1个；或第一对1个，第二对2个，第三对0个；或第一对1个，第二对0个，第三对2个；或第一对0个，第二对2个，第三对1个；或第一对0个，第二对1个，第三对2个，共7种，故C错误；
D、抗锈病和不抗锈病纯种小麦杂交得到F1，基因型为Aa，自交得到的F2的基因型为1/4AA，1/2Aa，1/4aa，F2中抗病品系中，AA占1/3，Aa占2/3，F2中抗病品系自交得到的F3代中AA=1/3+2/3×1/4=3/6，Aa=2/3×1/2=2/6，aa=2/3×1/4=1/6，故D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因的分离定律和自由组合定律的相关知识，意在考查考生能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或得出正确的结论的能力．