在苹果酸脱氢酶(malicdehydrogenase)作用下,苹果酸仲醇基脱氢氧化成羰基,生成草酰乙酸(oxalocetate),NAD+是脱氢酶的辅酶,接受氢成为NADH·H+,经线粒体内递氢体系传递,最终与氧结合生成水,在此过程中释放出来的能量使adp和pi结合生成ATP,凡NADH+H+参与的递氢体系,每2H氧化成一分子H₂O,生成3分子ATP.
该过程为呼吸链的一种,由复合物Ⅰ、Ⅲ和Ⅳ构成,从NADH来的电子依次经过这三个复合物,进行传递.
【氧化呼吸链由4种具有传递电子能力的复合体组成：
（1）复合体Ⅰ作用是将NADH+H+中的电子传递给泛醌
（2）复合体Ⅱ作用是将电子从琥珀酸传递到泛醌
（3）复合体Ⅲ作用是将电子从还原型泛醌传递给细胞色素c
（4）复合体Ⅳ将电子从细胞色素c传递给氧】
其ATP的生成都是在线粒体膜上的ATP合酶上生成,由于呼吸链产生了线粒体内外的电化学梯度,该酶就利用此梯度生产ATP.
【质子跨膜转运使得膜间隙积累了大量的质子,建立了质子梯度.由于膜间隙质子梯度的建立,使内膜两侧发生两个显著的变化∶线粒体膜间隙产生大量的正电荷,而线粒体基质产生大量的负电荷,使内膜两侧形成电位差；第二是两侧氢离子浓度的不同因而产生pH梯度（ΔpH）,这两种梯度合称为电化学梯度（electrochemical gradient）.】