所谓的“第三层膜”应该指构成基粒的膜,从动态结构分析,不同于一般意义上的内膜和外膜.
楼主如果注意叶绿体的形成与分裂可以发现,形成基粒的膜完全来源于内膜的内折,从这点上说,类似于线粒体的嵴.而且与嵴的动态过程类似,基粒的结构和组成也是与代谢功能高度相关的.
但是,可以肯定的是,基粒形成之后,类囊体腔与叶绿体的基质是隔离的.从拓扑学上说,也可以视为独立的第三层膜.这种隔离在光合作用和代谢途径中都有极为重要的作用.楼主的问题就在这里.多注意膜蛋白,尤其是电子传递链在膜上的分布,注意代谢途径和膜的动态转化,楼主的问题自然迎刃而解.
另外,定位于类囊体内的蛋白需要一段单独的N端序列也间接证明类囊体腔与基质是分隔的.
当然,还取决于楼主对膜的定义.我认为,如果把膜定义为功能的组分,用膜蛋白来表征膜,那么说叶绿体有三层膜是完全正确的.