解题思路：（1）分析飞船动能和重力势能大小的变化，从动能和重力势能大小的影响因素考虑．
动能大小的影响因素：质量、速度．质量越大，速度越大，动能越大．
重力势能大小的影响因素：质量、被举得高度．质量越大，高度越高，重力势能越大．
（2）不计空气阻力时，机械能守恒，考虑空气阻力时，克服阻力做功，机械能转化为内能，机械能减小，内能增加．
飞船进入大气层的一段时间里，由于受空气阻力做匀速运动，质量不变，速度不变，动能不变．高度减小，重力势能减小．
飞船运动过程中，受到空气阻力作用，克服阻力做功，机械能减小，内能增大．
故选B．
点评：
本题考点： 动能和势能的大小变化．
考点点评： （1）掌握动能、重力势能、弹性势能的影响因素．
（2）能判断动能、重力势能、弹性势能、机械能的变化．