A、增加二氧化碳的浓度对呼吸作用有明显的抑制效应．这可以从化学平衡的角度得到解释．据此原理，在大棚内，增加二氧化碳的浓度，可以降低蔬菜的呼吸作用，减少有机物的分解．故A错误；
B、植物进行呼吸作用消耗氧气分解有机物，释放能量，而种子内的物质必须先溶解在水里才能被种子利用，因此种子含水多，呼吸作用旺盛，含水少，种子的呼吸作用较弱．晒干的种子，水分减少，抑制了种子的呼吸作用，可以延长了种子的储存时间．故B错误；
C、给农作物施用化肥，为农作物提供无机盐，与呼吸作用无关，故C错误；
D、植物的根呼吸的是空气中的氧气．给植物松土，可以使土壤疏松，土壤缝隙中的空气增多，有利于促进根的呼吸，促进根的生长．D正确．
故选：D．