解题思路：种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质是种群基因频率的改变．突变和基因重组，自然选择及隔离是物种形成过程的三个基本环节，通过它们的综合作用，种群产生分化，最终导致新物种形成．在这个过程中，突变和基因重组产生生物进化的原材料，自然选择使种群的基因频率定向改变并决定生物进化的方向，隔离是新物种形成的必要条件．
A、基因突变产生的性状对生物具有多害少利性，但基因突变对生物进化有利，能为生物进化提供原材料，A错误；
B、在减数第一次分裂后期的过程中，非同源染色体的自由组合能导致基因重组，B正确；
C、环境条件稳定时种群的基因频率也会由于基因突变、迁入迁出等发生变化，C正确；
D、突变和基因重组为生物进化提供了原材料，D正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 基因突变的特征；基因重组及其意义；现代生物进化理论的主要内容．
考点点评： 本题的知识点是基因突变的特点和意义，变异的来源，变异在生物进化过程中的作用，对于相关知识点的综合理解应用是解题的关键．