（1）将甲装置在适宜的温度中，1号种子由于没有一定的水而不萌发，3号种子因浸没在水中缺乏空气而不能萌发，而2号种子由于满足一定的水分、适宜的温度和充足的空气等种子萌发的条件会萌发；由于乙装置在温度比较低的环境中，由于温度太低，所以3粒种子都不会萌发，故只有2号种子能够萌发，其他五粒（13456）种子均不萌发．
（2）探究光照对种子的萌发的影响，设计对照试验时，要注意变量的是光，其他条都应相同．1个装置是在有光的环境中，另一个装置应放在黑暗环境中，通过实验结果验证自己的假设是否成立．
故答案为：
（1）2；13456；适宜的水分；一定的温度；充足的空气
（2）黑暗；有光照